波拿巴的行动，所有经理联合在一起的情况下，他这个董事长就危在旦夕了。
为了维护公司的团结稳定，热罗姆波拿巴也有必要容忍圣阿尔诺的一些“小任性”。
“陛下！不知道您找我过来有什么事？”圣阿尔诺不卑不亢地询问热罗姆波拿巴。
“是这样的！随着秘书厅的权能越来越大，我希望战争部与秘书厅的权责能够分割开来。总是这样搅和在一起，无论是对战争部还是对秘书厅都没有任何好处！”热罗姆波拿巴先是隐晦地提出将秘书厅从战争部下属分离的意见。
“陛下，我也认为战争部与秘书厅存在着一些模糊不清的界限问题！”圣阿尔诺立刻表示同意。
热罗姆波拿巴点了点头接着说道：“你还记得我当初向你许诺过，未来的秘书厅将会作为掌管军队指挥的机构，也就是总参谋部。重组之后的总参谋部将会拥有更多的自主权，他将不再只担任统帅幕僚的身份……”
圣阿尔诺点了点头，他的心跳也不由得快了一拍。
“我决定……”热罗姆波拿巴故意停顿了一下，随后用手指着圣阿尔诺道：“由你担任总参谋部的第一任总参谋长！”
突如其来的惊喜让圣阿尔诺有些懵逼，原本对于总参谋长不抱有什么希望的圣阿尔诺从没有想过皇帝竟然会如此重视自己的承诺。
圣阿尔诺感觉到羞愧，他为自己在担任战争大臣之后“阻挠”军队改革的行为而羞愧，为总统不计前嫌任命自己为第一任总参谋长而羞愧。
作为能够号令所有军区司令的总参谋长，它所拥有的权利已经相当于部分皇帝的权利。
这么庞大的权利交给他，足以见得热罗姆波拿巴对于他的信任。
【ps：战争部的具体权力由总统来指定，理论上来说战争部能够指挥法兰西境内外的所有行动，然而这些行动只涉及到最终的战略意图，中间的过程需要司令自行判断。
克里米亚战争时期，战争大臣圣阿尔诺卸任担任克里米亚总司令之后，瓦扬元帅接替战争部的位置。每一次的行动瓦扬元帅都只给出了战略最终达成的目标，具体的行动瓦扬没有一点权力进行干涉。
总参谋长不仅掌管了战争的意图走向，还能够管理军队的战略意图，节制军级别司令的行动。】
“陛下，我……我……”面对热罗姆波拿巴这份毫无保留的信任，饶是铁打汉子的圣阿尔诺也不由得哽咽起来：“我对不起您……我辜负了您的信任！”
“没什么！”热罗姆波拿巴拍了拍圣阿尔诺的肩膀道：“人一旦坐在了那个位置上总会有一些身不由己的事情！”
随后，热罗姆波拿巴表情郑重地说道：“不过，我希望你能够明白一件事！”
“什么事？我一定听您的！”圣阿尔诺赶忙说道。
“斗争归斗争，我绝对不允许军队出现毫无底线的斗争！一旦出现了这种情况，那么就别怪我翻脸不认人了！”热罗姆波拿巴语气生硬地说着。
“明白！”圣阿尔诺向热罗姆波拿巴保证一定不会干出分裂法兰西军队的事情。
“你还没有吃饭吧！要不要一起吃一顿，我们两个已经很久没有坐下来吃饭了！”热罗姆波拿巴向圣阿尔诺发出邀请。
圣阿尔诺欣然同意了热罗姆波拿巴的邀请，两人离开书房前往餐厅。
这顿晚餐总共花费了将近一个多小时的时间结束，其间热罗姆波拿巴与圣阿尔诺同样也讨论了许多关于法兰西军队现在存在的情况。
圣阿尔诺同样也向热罗姆波拿巴保证一定会严厉争夺法兰西军队的问题。
4月末，杜伊勒里宫向战争部发出了建立总参谋部的命令。
时任战争部部长的圣阿尔诺接受命令，秘书厅正式脱离战争部，同已有的总参谋部合并
正当外界猜测将会有哪一位元帅担任总参谋长的时候，圣阿尔诺向热罗姆波拿巴提出了辞职。
热罗姆波拿巴迅速批准了圣阿尔诺的辞职，然后任命第一师师长库赞蒙托邦担任战争部部长、康罗贝尔将军接任库赞蒙托邦担任第一师。
卸任后后的圣阿尔诺将军在第二天就被热罗姆波拿巴安排在了新任总参谋长的位置之上，可以说是无缝衔接了。