门下弟子全数派到轩辕身边，帮助轩辕治理天下。于是，阐教借着人皇的优势，逐渐在人族兴盛起来。
却说轩辕继位，在广成子的鼓动下，一心想建立丰功伟业，希望自己的功绩能够不弱伏羲神农二位人皇，于是在广成子的鼓动下，他便下令人族各个部落强兵练武，如有不从他则以强硬的手段迫使对方服从自己的命令。
人族各个部落虽然对轩辕这番举动颇有微词，但却不可否认，轩辕的这一番举动促使了人族的大融合，使人族的势力大增。
然而，这样的行为，却是给了其心有异的九黎部落一个借口，言及人皇无道，罔顾众部落的信任，却是率兵攻打轩辕部落。
却说这蚩尤，乃是巫族十三祖巫蚩尤转世。可能因为身怀巫族血脉，并且极其亲近巫族的缘故，蚩尤出生不久后血脉就觉醒了，而且也记起了前世的种种，蚩尤发现现在乃是人族为主角，知道巫妖二族大概都失败了，心中伤心不已，不过他知道凭借现在的巫族是不可能恢复昔日荣光的，不说现在巫族式微，不能和现在的人族相抗衡，就算能，那些圣人和大神通者也是不会允许的，最后大概只能落一个族灭的下场。
何况现在自己也不是是纯粹的巫族了，不过蚩尤还是不想放弃恢复巫族昔日荣光的想法，至少也要巫族能够和人族一样正大光明的生活在这天地之间，而不是如现在那样蜗居于祖巫殿或幽冥地狱之中，因此蚩尤想到了一个方法，自己虽然有巫族血脉但也有人族血脉，如果自己能够成为人皇，那么就可以以人皇的名义重兴巫族，恢复巫族昔日的荣耀，和人族一起自由自在的生存在这片天地之间，这样不但是在圣人可以的接受范围之内，不会为巫族带来灾难，而且自己也可以成就人皇果位，如圣人一般不死不灭，得享永恒。
因此，蚩尤成为部落首领之后，便大力发展实力，眼看轩辕刚刚继位，根基不稳，也没有得到一众人族的认可，自己想要成为人皇，那就只有将轩辕从人皇之位拉下来，因此，蚩尤立刻整合九黎部落的实力。以巫族秘法开始训练族中勇士，随后凭借实力统一了九黎部落，将九个部落合并成了一个大部落九黎部落，一统九黎后，蚩尤将部落划分为八十一个部分，又从中挑出族中实力强大的八十一个族人于之结为兄弟，每个兄弟管理一个部分。这八十一个族人都觉醒了巫族血脉，蚩尤又将巫族神通传给这些兄弟，众兄弟纷纷神通大增，都达到了小巫境界。
如此一来，蚩尤可谓是兵强马壮，直接出兵攻击轩辕，自人族大兴一来，攻打人皇的事情还是都一次，轩辕没有想到蚩尤竟然会抢先出兵，一时间被打了个措手不急，损失惨重。如果不是有广成子和一众阐教金仙相助，恐怕只此一战他就会丢掉人皇之位。